1997年，第一次合校后，宁夏大学保卫处由原宁夏大学保卫处、宁夏工学院保卫科、宁夏教育学院与银川师专保卫科合并组建。
1999年扩招后，学生人数增加，安全管理工作难度加大。为切实加强安全管理工作，经校党委研究，决定在保卫处再增设办公室、北校区保卫科、南校区保卫科和校卫队。至此保卫处下属科级机构由两个增加到六个，使保卫工作在组织上有了保障。
2002年第二次合校后，随着校党政部门迁入新校区（现贺兰山校区）。为便于管理，2004年学校对保卫处科级机构进行了调整，调整后的科级机构为保卫处综合科、政治保卫科、安全管理科、保卫一科、保卫二科、南校区保卫科（现金凤校区保卫科）。
2013年，本着“消防安全无小事”，进一步将消防工作落到实处，经校党委常委会会议研究，增设消防科，负责全校消防安全工作。
2023年根据学校总体改革要求，进一步优化人力资源配置，提高管理服务效能，建立与西部一流大学相适应的高效能现代大学治理体系，切实提升办学治校能力和水平，根据《宁夏大学党群行政部门（机构）编制方案》（宁大党发〔2023〕32号）要求，保卫处内设综合办公室、政治保卫中心、技术防范中心、安全管理中心、消防安全中心5个机构，核定人员编制22+6（编制+劳务派遣）。
